平行志愿对保护高分考生落榜确实效果明显，对考生有利，但对高校来说却不是一件好事。山东多所高校的招生负责人表示，由于平行志愿录取是将文理科考生全省大排队，从高分到低分考生依次录取，一本线上考生人数是一定的，高校招生计划也是一定的，这种按部就班的录取结果就是高分生进了好学校、中分段学生进了中游高校，没有任何悬念。一名招生负责人表示，实行平行志愿后，会将高校的录取分数段压得很扁，最高分与最低分考生之间的分差会很小，这对高校来说并不是件好事。
现在的高校之间竞争的就是好生源，好的生源直接决定了4年后高校向社会交出的成绩单，优秀的`生源甚至会影响高校将来的发展。一名高校招生负责人表示，高校支持平行志愿的另一个原因是，实行平行志愿的省份基本上不允许高校因为分数偏低退档，因此在录取时高校需要演练多次才能确定最终的投档比例，如果投档比例定高了，投进考生多于我们的招生计划，我们只能退档，如果退不了会很麻烦，学校没有那么多预留计划；但如果按照1:1的比例投档，考生不服从专业调剂，就会出现进档满额但录取不满额的情况。
